Perbezaan utama antara RQ dan RER adalah bahawa RQ adalah pengukuran langsung yang diambil dari darah dan RER dalam pengukuran tidak langsung yang diambil melalui nafas.
Calorimetri mengukur kuantiti haba yang dibebaskan dari metabolisme atau perbelanjaan tenaga. Metabolisme memerlukan oksigen, dan menghasilkan karbon dioksida. Nafas pernafasan (RQ) dan nisbah pertukaran pernafasan (RER) adalah dua pengukuran kalorimetri yang serupa. Walau bagaimanapun, RQ adalah pengukuran langsung yang diambil dari darah. Ia adalah pertukaran metabolik nisbah gas yang sama dengan pengeluaran CO 2 berbanding pengambilan oksigen (CO 2 / O 2). RER adalah pengukuran tidak langsung yang diukur melalui nafas. Oleh itu, RQ adalah kaedah invasif, sementara RER adalah kaedah bukan invasif.