Perbezaan utama antara parasit dan bakteria adalah bahawa bakteria adalah prokariota mikroskopik uniselular yang hidup di seluruh sementara parasit adalah organisma yang hidup di dalam atau di dalam inangnya semasa menyebabkan jangkitan pada host.
Parasit dan bakteria adalah organisma yang menyerupai organisma yang sangat primitif tetapi mempunyai penyesuaian yang hebat untuk bertahan dalam keadaan persekitaran yang berbeza. Bagi manusia, organisma ini sangat penting kerana sebahagian besar jangkitan manusia disebabkan oleh mereka. Kadang kala, bakteria tertentu dianggap sebagai parasit.
