Perbezaan utama antara kariotip dan idiogram adalah bahawa kariotip adalah gambaran sebenar kromosom total sel sementara idiogram adalah gambarajah skematik kariotip yang menggambarkan semua peta kromosom.
Satu set kromosom mewakili genom dan maklumat genetik organisma. Setiap kromosom mempunyai bentuk, ukuran dan sekumpulan gen yang unik. Bilangan dan struktur fizikal kromosom menunjukkan maklumat penting mengenai organisma. Karyotyping adalah teknik yang dilakukan untuk memeriksa set lengkap kromosom dalam sel. Jumlah kromosom dikumpulkan dan dianalisis semasa ujian ini untuk menentukan sama ada terdapat kelainan berangka atau struktur pada kromosom. Gambaran sebenar yang menunjukkan jumlah kromosom sel adalah kariotip manakala gambarajah skematik dari total kromosom sel adalah idiogram. Kedua-duanya penting dalam kajian sitogenetik.
