Perbezaan utama antara sistem fail dan pangkalan data adalah bahawa sistem fail hanya menguruskan akses fizikal sementara pangkalan data menguruskan akses fizikal dan logik ke data.
Pangkalan Data dan Sistem Fail adalah dua kaedah yang membantu menyimpan, mengambil, mengurus dan memanipulasi data. Kedua-dua sistem ini membolehkan pengguna bekerja sama dengan data. Sistem Fail adalah kumpulan fail data mentah yang disimpan di dalam cakera keras, sedangkan pangkalan data bertujuan untuk mengatur, menyimpan dan mengambil sejumlah besar data dengan mudah. Dengan kata lain, pangkalan data menyimpan sekumpulan data teratur biasanya dalam bentuk digital untuk satu atau lebih pengguna. Singkatan dari pangkalan data adalah DB. Adalah mungkin untuk mengklasifikasikan DB mengikut kandungannya, seperti teks-teks, bibliografi dan statistik. Penting untuk diperhatikan bahawa, walaupun dalam pangkalan data, data akhirnya atau secara fizikal disimpan dalam beberapa fail.
