Perbezaan utama antara gen holandrik dan hubungan seks adalah bahawa gen holandrik adalah satu bentuk gen yang berkaitan dengan seks yang terletak pada kromosom Y manakala gen yang berkaitan dengan seks adalah gen yang terletak pada kromosom seks.
Sepasang kromosom seks dapat menentukan jantina manusia dan mamalia lain. Lelaki mempunyai kromosom XY, sementara wanita mempunyai kromosom XX. Kromosom X dan Y tidak homolog. Mereka juga tidak membawa gen yang sama. Kromosom Y lebih pendek dan membawa sebilangan kecil gen berbanding kromosom X. Gen pada kromosom X dikenali sebagai gen berkait X. Begitu juga, gen yang terletak di kromosom Y dikenali sebagai gen berkait Y atau gen holandrik. Kedua-dua gen yang dikaitkan dengan X dan Y biasanya dikenali sebagai gen yang berkaitan dengan seks.
