Perbezaan utama antara pencernaan heterotrof dan saprotrophs adalah bahawa pencernaan heterotrof adalah intraselular sementara pencernaan saprotrophs adalah ekstraselular.
Pencernaan adalah proses penting untuk kelangsungan hidup organisma. Melalui proses ini, nutrien tersedia untuk diserap oleh organisma. Pencernaan heterotrofik adalah proses pencernaan intraselular dalam organisma, yang bergantung pada makanan organik. Pencernaan saprotrofik adalah proses pencernaan ekstraselular di mana organisma bergantung kepada bahan organik yang mati. Kedua-dua pencernaan heterotrof dan saprotrof adalah penting untuk kelangsungan hidup biosfera. Heterotrof bergantung kepada bahan organik dari tumbuhan dan sumber haiwan lain. Sebaliknya, saprotrof secara langsung bergantung kepada bahan organik mati untuk pemakanannya. Oleh itu, mempelajari corak pencernaan ini membantu dalam mengkaji hubungan pemakanan dalam organisma.