Perbezaan utama antara pensterilan dan pembasmian kuman adalah bahawa pensterilan adalah proses membunuh semua bentuk kehidupan mikroba termasuk spora yang terdapat dalam objek sementara pembasmian kuman adalah proses mengurangkan atau membuang mikroorganisma berbahaya dari objek dan permukaan yang tidak bernyawa.
Mikroorganisma ada di mana-mana. Oleh kerana ia menyebabkan pencemaran, jangkitan dan pembusukan, maka perlu untuk membuang atau memusnahkannya dari bahan atau kawasan melalui proses pencemaran. Pensterilan dan pembasmian kuman adalah dua kaedah penyahtinjaan. Pembasmian kuman bertujuan membunuh mikroba ke tahap yang tidak ditularkan oleh jangkitan, tetapi tidak semestinya membunuh semua mikroorganisma yang terdapat di dalam benda mati. Walau bagaimanapun, pensterilan adalah proses dekontaminasi di mana semua mikroorganisma yang terdapat dalam suatu objek memusnahkan, dan akibatnya, objek tersebut menjadi steril. Oleh itu, proses pensterilan membunuh spora termasuk endospora bakteria juga. Pendek kata,kita boleh mengatakan bahawa pensterilan membunuh semua mikroorganisma yang terdapat di dalam objek atau tempat sedangkan pembasmian kuman hanya mengurangkan bilangan mikroorganisma berbahaya untuk mencegah penularan.
