Perbezaan utama antara klorofil A dan B adalah bahawa klorofil A adalah pigmen fotosintetik utama pada tumbuhan dan alga sementara klorofil B adalah pigmen aksesori yang mengumpulkan tenaga dan mengalir ke klorofil A.
Klorofil adalah keluarga pigmen semula jadi yang terdapat di dalam tumbuhan dan alga dan bertanggungjawab terhadap warna hijau mereka. Klorofil menyerap tenaga dari cahaya matahari dan memanfaatkan tenaga ini untuk mensintesis karbohidrat dari air dan karbon dioksida. Proses yang disebut fotosintesis inilah yang menunjang proses hidup di semua tanaman kerana keperluan tenaga mereka dipenuhi melalui proses ini. Selanjutnya, fotosintesis adalah proses utama yang menyokong semua organisma hidup kerana tumbuhan adalah pengeluar utama semua rantai makanan. Haiwan dan manusia memakan hasil tanaman. Dalam keluarga pigmen klorofil, terdapat beberapa jenis pigmen klorofil. Antaranya, klorofil A dan klorofil B adalah dua jenis klorofil. Mereka mempunyai struktur yang serupa dengan sedikit perbezaan pada cincin porphyrin. Klorofil A mempunyai CH3 kumpulan dalam cincin porphyrin sementara klorofil B mempunyai CHO (kumpulan aldehid) di cincin porphyrin.
