Perbezaan utama antara GFP dan EGFP adalah bahawa GFP adalah protein jenis liar yang digabungkan dalam pengklonan molekul sel bukan mamalia sedangkan EGFP adalah jenis GFP yang diperbaiki atau direkayasa yang dapat digunakan pada sel mamalia.
Pengklonan molekul adalah teknik canggih yang banyak digunakan para saintis dalam mengekspresikan protein melalui teknologi rekombinan. Dalam teknologi DNA rekombinan, perlu mengubah vektor rekombinan berjaya menjadi tuan rumah organisma. Oleh itu, semasa proses transformasi, ia harus dikenal pasti dan disahkan sama ada gen yang diminati telah diubah atau tidak kepada inang. Untuk menilai ini, ahli biologi molekul menggunakan beberapa teknik. Dari teknik tersebut, salah satunya adalah gen pemberita. Gen reporter ini bertindak sebagai penanda yang boleh dipilih untuk memilih transforman yang betul. Oleh itu, Protein Fluoresen Hijau (GFP) dan Protein Fluoresen Hijau Enhanced (EGFP) adalah dua protein wartawan yang digunakan dalam pengklonan molekul.
