Perbezaan utama antara transkripsi prokariotik dan eukariotik adalah bahawa transkripsi prokariotik berlaku di sitoplasma sementara transkripsi eukariotik berlaku di dalam nukleus.
Dalam sel, DNA membawa maklumat dari generasi ke generasi yang mengawal aktiviti sel. Lebih-lebih lagi, DNA bertanggungjawab untuk mensintesis semua protein yang mempunyai fungsi dan peranan struktur dalam sel. Oleh itu, dengan mensintesis protein sedemikian, DNA mengawal aktiviti sel. Gen yang mengandungi maklumat genetik untuk menghasilkan protein harus dinyatakan untuk mensintesis protein masing-masing. Ekspresi gen berlaku melalui dua langkah utama iaitu transkripsi dan terjemahan. Oleh itu, transkripsi adalah langkah pertama ungkapan gen. Ia diikuti dengan terjemahan. Semasa transkripsi, maklumat genetik pada DNA berubah menjadi urutan kod genetik tiga huruf dalam mRNA. Semasa terjemahan, mRNA diubah menjadi rantai polipeptida.
