Perbezaan utama antara vertebrata dan chordate adalah bahawa vertebrata adalah subphylum utama chordate yang mempunyai lajur vertebra sementara chordate adalah haiwan yang sangat berevolusi yang memiliki notochord, tali saraf dorsal, celah faring, endostyle, dan post-anal ekor dalam beberapa jangka masa hidup mereka.
Vertebrata adalah kumpulan utama chordate mengenai jumlah spesies, kecanggihan evolusi, dan banyak aspek lain juga. Lebih-lebih lagi, banyak orang percaya bahawa chordate sama dengan vertebrata. Walau bagaimanapun, chordate merangkumi dua subphyla lain daripada vertebrata. Mereka adalah subphylum Tunicata (atau Urochordata) dan subphylum Cephalochordata. Oleh itu, tidak semua chordate adalah vertebrata, tetapi semua vertebra adalah chordate. Oleh itu, artikel ini cuba mengetengahkan perbezaan yang ada antara vertebrata dan chordate secara terperinci.