Perbezaan utama antara E. coli dan Klebsiella ialah E. coli adalah bakteria berbentuk batang gram-negatif yang bergerak sedangkan Klebsiella adalah gen dari bakteria berbentuk batang gram-negatif yang tidak bergerak.
Escherichia dan Klebsiella adalah dua jenis bakteria koliform yang biasa. Kedua-dua genera terdiri daripada bakteria gram-negatif, berbentuk batang, bukan spora. E. coli adalah spesies Escherichia. Ia adalah bakteria koliform faecal motile. Kedua-dua bakteria E. coli dan Klebsiella tergolong dalam keluarga Enterobacteriaceae. Mereka adalah sebahagian daripada flora normal di usus kita. Tambahan pula, mereka adalah anaerob fakultatif. Kedua-duanya pada amnya tidak berbahaya, tetapi, mereka menjadi patogen manusia oportunis dalam situasi tertentu.
