Perbezaan utama antara Golgi Bodies dan Mitokondria adalah pada fungsi yang mereka lakukan. Fungsi utama badan Golgi (atau alat Golgi) adalah pengubahsuaian, penyortiran, dan pembungkusan protein untuk rembesan sementara fungsi utama mitokondria adalah pengeluaran mata wang tenaga sel (ATP) melalui pernafasan.
Sel eukariotik mengandungi organel sel seperti badan Golgi, mitokondria, lisosom, ribosom, nukleus, dan lain-lain. Ini adalah organel penting yang diperlukan untuk fungsi sel. Badan Golgi adalah bahagian dari sistem endomembran yang terdiri daripada vesikel dan membran yang dilipat sementara Mitokondria adalah organel berbentuk kacang berbentuk membran ganda yang terdapat dalam sel eukariotik.