Perbezaan utama antara Coliforms dan Enterobacteriaceae adalah bahawa Coliform adalah sekumpulan gram negatif, berbentuk batang dan bakteria fermentasi laktosa sementara Enterobacteriaceae adalah sekumpulan besar bakteria gram negatif.
Organisme penunjuk adalah organisma yang mempunyai penggunaan sebagai tanda untuk menunjukkan keadaan tertentu. Mereka menunjukkan adanya sesuatu yang tidak normal. Coliforms dan Enterobacteriaceae adalah bakteria penunjuk yang menunjukkan tanda kualiti makanan dan air yang bersih dan juga menunjukkan keadaan persekitaran. Lebih-lebih lagi, semua Coliform termasuk dalam Enterobacteriaceae, tetapi semua anggota Enterobacteriaceae bukan Coliforms.