Perbezaan utama antara penjujukan genom keseluruhan dan penjujukan exome adalah bahawa penjujukan penjujukan genom keseluruhan genom organisma sementara urutan penjujukan exome hanya gen eksome atau protein pengekodan organisma.
Urutan adalah teknik yang menentukan urutan nukleotida tepat dalam molekul DNA tertentu. Ini hanya menggambarkan susunan empat asas yang betul; adenin (A), guanin (G), sitosin (C) dan timin (T) dalam serpihan DNA. Terdapat beberapa kaedah penjujukan seperti penjujukan Sanger, penjujukan generasi seterusnya, dan lain-lain. Selanjutnya, sama ada genom lengkap organisma (penjujukan keseluruhan genom) atau hanya gen pengekodan protein dalam genom (penjujukan exome) yang dapat menjalani penjujukan.
