Perbezaan utama antara glikoksisom dan peroksisom adalah bahawa glikoksisom hanya terdapat pada sel tumbuhan dan kulat filamen sementara peroksisom terdapat di hampir semua sel eukariotik. Glyoxysomes banyak terdapat pada sel tumbuhan biji percambahan sementara peroxisomes banyak terdapat pada sel hati dan ginjal.
Kedua organel ini adalah badan mikro yang terdapat dalam sel eukariotik. Glyoxysomes adalah peroksisom khusus yang hanya terdapat pada sel tumbuhan dan kulat filamen. Peroksisom adalah organel yang membantu memecah rantai asid lemak panjang dan menyahtoksin sel. Mereka menurunkan alkohol dan sebatian berbahaya yang lain.
