Perbezaan utama antara ribozim dan enzim protein adalah bahawa ribozim adalah molekul RNA yang mampu mengkatalisis reaksi biokimia tertentu sementara enzim protein adalah molekul protein yang mampu menjadi pemangkin sebahagian besar tindak balas biokimia yang berlaku pada organisma hidup.
Enzim adalah pemangkin biologi, dan mereka mempercepat kadar tindak balas biokimia. Secara amnya, semua enzim adalah protein yang terdiri daripada asid amino. Oleh itu mereka juga disebut sebagai enzim protein. Walau bagaimanapun, terdapat molekul RNA spesifik yang dapat bertindak sebagai pemangkin tindak balas biokimia tertentu. Mereka adalah enzim ribozim atau asid ribonukleik. Oleh itu, kedua-dua enzim ribozim dan protein menjalankan fungsi yang sama iaitu pemangkin reaksi biokimia.
