Perbezaan utama antara protein sederhana dan protein konjugasi adalah bahawa protein sederhana terbuat dari asid amino yang diikat bersama untuk membentuk molekul besar, sedangkan protein konjugasi adalah molekul kompleks yang mengandungi protein sederhana dan komponen bukan protein.
Protein adalah molekul biopolimer. Maksudnya; molekul protein mengandungi sebilangan unit berulang yang terikat pada ikatan kovalen. Unit berulang ini mewakili asid amino yang digunakan dalam pembentukan protein. Mengikut komposisi kimia protein, terdapat dua jenis protein sebagai protein sederhana dan protein konjugasi.
