Perbezaan utama antara imuniti sel yang dimediasi sel dan antibodi adalah bahawa imuniti yang dimediasi sel memusnahkan zarah berjangkit melalui lisis sel oleh sitokin, tanpa penghasilan antibodi, sementara imuniti yang dimediasi oleh antibodi memusnahkan patogen dengan menghasilkan antibodi khusus terhadap antigen.
Kekebalan yang dimediasi sel dan imuniti yang dimediasi oleh antibodi adalah dua jenis mekanisme pertahanan utama yang berlaku di dalam badan kita. Kekebalan yang dimediasi sel beroperasi terhadap patogen intraselular. Oleh itu, ia berfungsi di dalam sel yang dijangkiti dan memusnahkan patogen dengan membebaskan sitokin. Sebaliknya, imuniti yang dimediasi antibodi beroperasi terhadap patogen ekstraselular dengan menghasilkan antibodi terhadap antigen yang terdapat di luar sel yang dijangkiti atau bebas beredar dalam darah. Lebih-lebih lagi, limfosit B menjalankan imuniti yang dimediasi oleh antibodi sementara limfosit T melakukan imuniti yang dimediasi sel.