Perbezaan utama antara mutagen dan teratogen adalah bahawa mutagen adalah zat atau agen yang menyebabkan perubahan urutan DNA seseorang sementara teratogen adalah agen yang menyebabkan bahaya pada janin atau embrio yang sedang berkembang semasa kehamilan.
Mutagens dan teratogen biasanya merupakan agen kimia. Walau bagaimanapun, agen fizikal dan biologi juga boleh bertindak sebagai mutagen atau teratogen. Kedua-duanya boleh membawa kepada kesan yang sangat berbahaya atau mematikan pada individu. Walau bagaimanapun, peningkatan bioteknologi telah memberi pandangan baru kepada kedua-dua konsep mutagens dan teratogen.
