Perbezaan utama antara kromosom homolog dan homeolog adalah kromosom homolog adalah kromosom dengan keturunan yang sama sedangkan kromosom homeolog adalah kromosom yang mempunyai sifat yang samar-samar dan sebagian homolog.
Kromosom adalah komponen struktur yang membawa maklumat genetik organisma. Bahan nuklear dalam eukariota disusun untuk membentuk kromosom, yang merupakan struktur ringkas asid nukleik dan protein. Selain itu, terdapat pelbagai jenis kromosom berdasarkan cara mereka menjalani pembelahan sel. Kromosom homolog dan homeolog adalah dua jenis kromosom yang memainkan peranan penting dalam bidang genetik.