Perbezaan utama antara metafasa 1 dan 2 adalah bahawa dalam metafasa 1, kromosom homolog berpasangan pada plat metafasa sementara dalam metafasa 2, kromosom tunggal berbaris di plat metafasa.
Meiosis adalah proses yang mengubah sel diploid menjadi empat sel haploid semasa pembentukan gamet. Ini adalah proses penting kerana meningkatkan kepelbagaian genetik di kalangan keturunan. Meiosis sangat penting dalam pembiakan seksual kerana kepentingannya dalam pembentukan sel haploid. Meiosis berlaku melalui dua bahagian nuklear berturut-turut yang disebut meiosis I dan meiosis II. Setiap bahagian nuklear dapat dibagi lagi menjadi Prophase, Metaphase, Anaphase dan Telophase. Oleh itu, metafasa adalah tahap pembahagian sel di mana kromosom menyusun sepanjang plat Metafase. Metafasa 1 boleh didapati di meiosis I manakala metafasa 2 boleh didapati di meiosis II. Metafasa 1 dan 2 berbeza antara satu sama lain.