Perbezaan Utama - Urutan Exome vs RNA
Penjujukan asid nukleik adalah teknik yang menentukan urutan nukleotida dalam serpihan DNA atau RNA organisma tertentu. Urutan penting dalam mengenal pasti susunan DNA dan RNA sel dan membezakan gen tertentu yang memberi kod untuk protein berfungsi; dengan itu, penjujukan dapat digunakan untuk memahami mutasi gen dan ekspresi gen ini. Kaedah penjujukan Sanger atau kaedah penjujukan generasi seterusnya yang lebih maju adalah kaedah penjujukan yang biasa digunakan. Urutan eksome adalah penjujukan sekumpulan lengkap ekson atau kawasan DNA pengekodan yang terdapat dalam organisma sedangkan penjujukan RNA adalah prosedur penjujukan asid Ribonukleik (RNA). Ini adalah perbezaan utama antara urutan exome dan RNA.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Urutan Exome
3. Apakah Urutan RNA
4. Persamaan Antara Urutan Exome dan RNA
5. Perbandingan Berdampingan - Urutan Exome vs RNA dalam Borang Jadual
6. Ringkasan
Apa itu Urutan Exome?
Exome adalah subset dari genom yang terdiri daripada gen pengekodan organisma tertentu. Gen pengekodan dinamakan sebagai ekson dan ditranskripsikan ke dalam mRNA dan kemudian diterjemahkan ke dalam urutan asid amino. Semasa pengubahsuaian pasca transkripsional, mekanisme penyambungan RNA di eukariota membuang intron (kawasan bukan pengekodan), dan eksonnya tetap ada. Terdapat dua teknik utama di mana penjujukan exome dilakukan: berdasarkan penyelesaian dan berdasarkan larik.
Dalam penjujukan exome berasaskan larutan, sampel DNA dipecah menggunakan kedua-dua enzim sekatan atau kaedah mekanikal dan didenaturasi oleh haba. Dalam teknik ini, probe oligonukleotida biotinilasi (umpan) digunakan untuk hibrid secara selektif dengan kawasan sasaran dalam genom. Manik-manik streptavidin magnetik digunakan untuk langkah mengikat. Pengikatan diikuti oleh langkah mencuci di mana urutan yang tidak terikat dan tidak disasarkan dihanyutkan. Sasaran terikat kemudian diperkuat menggunakan tindak balas Rantai Polimerase (PCR) dan kemudian diurutkan menggunakan teknik penjujukan Sanger atau Penjujukan Generasi Seterusnya.
Gambar 01: Urutan Exome
Kaedah berasaskan larik juga serupa dengan kaedah berasaskan penyelesaian, kecuali bahawa serpihan DNA ditangkap ke dalam larik mikro, dan kemudian langkah pengikatan dan pencucian diikuti sebelum disusun.
Penjujukan urutan Exome digunakan dalam banyak aplikasi seperti diagnosis genetik penyakit, terapi gen, dalam mengenal pasti penanda genetik baru, dalam pertanian untuk mengenal pasti pelbagai sifat agronomi yang bermanfaat dan dalam prosedur pembiakan tumbuhan.
Apa itu Urutan RNA?
Urutan RNA didasarkan pada transkripome, yang merupakan transkrip lengkap sel. Tujuan utama penjujukan RNA adalah membuat katalog semua spesies transkrip, termasuk mRNA, RNA bukan pengekodan, dan RNA kecil, untuk menentukan struktur transkripsi gen dan untuk mengukur tahap ekspresi setiap transkrip semasa pengembangan. Semasa penjujukan RNA, teknologi hibridisasi (yang merupakan DNA pelengkap yang berasal dari urutan mRNA matang) pada mulanya digunakan untuk penjujukan. Pada masa ini, teknik through-put yang lebih tepat dan maju digunakan untuk penjujukan RNA.
Gambar 02: Urutan RNA
Dalam penjujukan RNA, sampel RNA yang dapat total RNA atau RNA pecahan ditukar menjadi DNA pelengkap (cDNA) menggunakan transkripsi terbalik, dan perpustakaan cDNA disediakan. Setiap serpihan cDNA dilekatkan pada penyesuai di kedua sisi (urutan akhir pasangan) atau di satu sisi (penjujukan akhir tunggal). Urutan yang diberi tag ini disusun mengikut urutan Sanger atau generasi seterusnya, seperti penjujukan exome.
Apakah Persamaan Antara Urutan Exome dan RNA?
- Fragmen terpilih pendek atau keseluruhan set DNA / RNA boleh digunakan untuk penjujukan Exome atau RNA.
- Fragmen yang diuraikan disimpan di perpustakaan.
- Penjujukan penjujukan atau penjujukan Generasi Seterusnya boleh digunakan.
- Kedua-duanya adalah kaedah penjujukan in vitro.
- Fragmen yang berurutan dapat ditentukan dengan tanda pendarfluor.
Apakah Perbezaan Antara Urutan Exome dan RNA?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
Urutan Exome vs RNA |
|
| Urutan Exome adalah penjujukan sekumpulan lengkap ekson atau kawasan DNA pengekodan yang terdapat dalam organisma. | Penjujukan RNA merujuk kepada prosedur penjujukan asid Ribonukleik (RNA); transkrip. |
| Contoh Permulaan | |
| DNA genom adalah contoh permulaan penjujukan exome. | RNA adalah contoh permulaan penjujukan RNA. |
| Komposisi | |
| Ini hanya mengandungi kawasan pengekodan dari total DNA yang dikenali sebagai Exons | Ini mengandungi RNA-mRNA / transkripome. |
| Urutan | |
| Terdapat dua kaedah utama penjujukan exome; berasaskan penyelesaian dan teknologi berasaskan larik. | Penjujukan RNA dilakukan melalui penyediaan perpustakaan cDNA dengan mengekstrak jumlah RNA atau RNA yang terfragmentasi. |
Ringkasan - Urutan Exome vs RNA
Exome adalah rangkaian lengkap wilayah pengekodan organisma dan teknik yang terlibat dalam penentuan susunan nukleotida tepat Exome dikenali sebagai penjujukan exome. Penjujukan RNA adalah teknik yang terlibat dalam penentuan susunan nukleotida RNA organisma. Ini adalah perbezaan antara penjujukan exome dan RNA.
Muat turun Versi PDF Exome vs RNA Sequencing
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam catatan petikan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara Urutan Exome dan RNA
