Perbezaan utama antara otot aerobik dan anaerobik adalah bahawa otot aerobik memerlukan oksigen untuk fungsinya, sedangkan otot anaerobik tidak memerlukan oksigen untuk berfungsi.
Otot adalah komponen utama yang terlibat dalam pergerakan kita. Lebih-lebih lagi, mereka membantu mengekalkan bentuk badan. Otot dapat bernafas secara aerobik dan anaerobik. Oleh itu, otot menjalani fungsi dengan kehadiran dan ketiadaan oksigen. Berdasarkan itu, terdapat dua otot iaitu otot aerobik dan anaerobik. Otot aerobik memerlukan oksigen untuk pernafasan selular mereka. Dengan kata lain, otot-otot ini bergantung pada oksigen untuk penjanaan tenaga. Oleh itu, mitokondria terdapat dalam jumlah yang banyak. Sebaliknya, otot anaerobik tidak memerlukan oksigen untuk penjanaan tenaga. Mereka mempunyai serpihan mitokondria atau enzim yang diperlukan untuk pernafasan anaerob. Oleh itu, mereka tidak bergantung kepada oksigen. Oleh itu, perbezaan utama antara otot aerobik dan anaerob adalah keperluan oksigen.