Perbezaan utama antara mutasi gen dan mutasi kromosom adalah bahawa mutasi gen menyebabkan perubahan urutan nukleotida gen sementara mutasi kromosom menyebabkan perubahan struktur segmen kromosom termasuk banyak gen.
Mutasi adalah perubahan kekal dari urutan nukleotida bahan genetik organisma. Mutasi gen dan mutasi kromosom adalah dua jenis mutasi asas, dan ia berbeza antara satu sama lain terutamanya pada besarnya perubahan. Mutasi berlaku kerana banyak sebab seperti langkah-langkah yang tidak menentu dalam mengatur replikasi dan transkripsi DNA, pendedahan kepada radiasi, sinar UV, akibat asap rokok, disebabkan oleh jangkitan virus dan bakteria, dll.
Penggantian, penyisipan, penghapusan, atau pendua urutan DNA adalah mekanisme utama yang mengubah urutan nukleotida. Beberapa mutasi berlaku dari ibu bapa ke keturunan ketika berlaku di sel kuman sementara yang lain tidak turun temurun. Selanjutnya, beberapa mutasi tidak mengubah urutan asid amino yang dihasilkan. Oleh itu mereka adalah mutasi senyap. Walau bagaimanapun, mutasi mungkin atau mungkin tidak baik untuk kegigihan di dunia sejak sekian lama. Individu atau populasi dengan gen yang disukai akan bertahan sementara watak yang tidak baik yang timbul kerana mutasi akan menghilangkan diri dari persekitaran dengan pemilihan semula jadi.
