Perbezaan utama antara homologi dan kesamaan dalam bioinformatik adalah bahawa homologi merujuk kepada pernyataan mengenai keturunan evolusi umum dari dua urutan sementara kesamaan merujuk kepada tahap kesamaan antara dua urutan.
Bioinformatika adalah bidang sains yang menggabungkan biologi, kejuruteraan maklumat, sains komputer, matematik dan statistik untuk menganalisis dan mentafsirkan data biologi. Homologi dan kesamaan adalah dua istilah yang kita gunakan dalam bidang bioinformatik. Kita dapat dengan mudah mengira kesamaan sebagai peratusan residu serupa sepanjang panjang penjajaran tertentu. Namun, kami tidak dapat mengira homologi kerana mungkin benar atau salah dan biasanya bergantung pada hipotesis yang digunakan.
