Perbezaan utama antara ectomycorrhizae dan endomycorrhizae adalah bahawa hyphae fungus tidak meresap ke dalam sel kortikal akar tumbuhan di ectomycorrhizae sementara hyphae fungus meresap ke dalam sel kortikal akar tumbuhan di endomycorrhizae.
Mycorrhizae adalah hubungan simbiotik penting yang berlaku antara kulat dan akar tanaman yang lebih tinggi. Kedua-dua kulat dan tumbuh-tumbuhan mendapat faedah daripada pergaulan ini. Hyphae kulat menembusi ke dalam tanah dan membawa nutrien kepada tanaman sementara tanaman juga memberi manfaat kepada kulat. Oleh itu, ia adalah hubungan yang penting secara ekologi. Yang paling penting, hyphae kulat boleh tumbuh beberapa meter dan mengangkut air dan nutrien, terutamanya nitrogen, fosforus, kalium ke akar. Lebih-lebih lagi, persatuan mikorizal melindungi tanaman daripada patogen akar. Oleh itu, gejala kekurangan nutrien jarang berlaku pada tanaman yang terdapat dalam hubungan simbiosis ini. Terdapat dua jenis mikoriza seperti ectomycorrhizae dan endomycorrhizae.
