Perbezaan Utama - Benzonase vs DNase
Degradasi asid nukleik adalah penting bagi banyak teknik biologi molekul. Ia digunakan secara meluas dalam teknologi DNA rekombinan untuk menyingkirkan serpihan DNA dan RNA yang tidak diingini. Enzim pengurai asid nukleik disebut sebagai Nuklease, dan boleh terdiri daripada pelbagai jenis berdasarkan fungsi yang diperlukan. Nuklease yang menurunkan DNA dikenali sebagai DNases sedangkan nuklease yang menurunkan RNA dikenali sebagai RNases. Enzim ini kebanyakannya digunakan dalam eksperimen in vitro di mana ujian molekul in vitro dilakukan untuk mengasingkan DNA, RNA atau protein murni. Benzonase adalah sejenis nuklease yang menurunkan DNA dan RNA sedangkan DNases hanya menurunkan DNA. Ini adalah perbezaan utama antara Benzonase dan DNase.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Benzonase
3. Apa itu DNase
4. Persamaan Antara Benzonase dan DNase
5. Perbandingan Berdampingan - Benzonase vs DNase dalam Borang Jadual
6. Ringkasan
Apa itu Benzonase?
Benzonase adalah endonuclease rekayasa genetik dari Serratia marcescens. Enzim ini dihasilkan dalam inang E. coli dalam skala industri. Benzonase mampu membelah DNA untai dua, DNA linear, DNA bulat dan RNA untai tunggal. Oleh itu, Benzonase adalah penting secara komersial. Enzim Benzonase adalah dimer protein yang mempunyai 245 asid amino yang sama, ~ 30 kDa subunit dengan dua ikatan disulfida penting. Benzonase memecah asid nukleik pada hujung 5 'dan menghasilkan serpihan dengan 5'ends percuma. Benzonase dapat memecah asid nukleik pada urutan apa pun tetapi lebih suka kawasan kaya GC.
Benzonase disimpan pada suhu -20 0 C. pH optimum untuk aktiviti enzim didapati 8.0 - 9.2. Aplikasi Benzonase merangkumi penyediaan sampel untuk elektroforesis gel protein 2D di mana Benzonase menghilangkan asid nukleik terikat dan penyingkiran bahan cemar asid nukleik dari sediaan protein rekombinan. Ia juga digunakan untuk mengurangi kelikatan ekstrak protein dan mencegah penggumpalan sel dalam campuran sel.
Apa itu DNase?
DNase adalah enzim nukleas, hidrolitik yang hanya mampu memecah DNA helai dua. Terdapat dua jenis utama DNases: DNase I dan DNase II. DNase I mengambil bahagian dalam membelah DNA untai dua untuk menghasilkan polinukleotida dengan hujung bebas 5 '. DNase II terlibat dalam pembelahan DNA helai dua untuk menghasilkan helai polinukleotida dengan hujung atau overhang 3 'bebas.
DNase I
DNase I berfungsi pada pH optimum antara 7.0 - 8.0. Aktiviti enzim bergantung kepada banyak kofaktor ion yang merangkumi, Ca 2+, Mg 2+ atau Mn 2+. Aktiviti Mg 2+ dan Mn 2+ memutuskan fungsi DNase I. Di hadapan Mg 2+, DNase I memotong setiap helai dsDNA secara bebas. Ini berlaku secara rawak. Sebaliknya, dengan adanya Mn 2+, enzim membelah kedua helai DNA di lokasi yang hampir sama. Pembelahan ini akan menghasilkan dua jenis serpihan DNA; satu jenis dengan hujung tumpul dan jenis yang lain dengan satu atau dua overhang nukleotida.
Gambar 02: DNase
DNase II
Fungsi DNase II pada pH optimum 4.5-5.0 dan ion logam divalen diperlukan untuk aktivitinya, serupa dengan DNase I. Mekanisme DNase II diketahui terdiri daripada tiga langkah utama.
- Pelbagai rehat untaian tunggal disebabkan oleh tulang belakang DNA.
- Nukleotida larut asid dan oligonukleotida dihasilkan.
- Peralihan hiperkromik tidak linear berlaku pada fasa terakhir.
Inhibitor utama enzim DNase merangkumi chelators logam, logam peralihan dan bahan kimia seperti Natrium dodecyl sulfate dan β - mercaptoethanol.
Aplikasi utama DNase termasuk penyediaan ekstrak RNA bebas DNA dan ekstrak protein, dan penyingkiran DNA templat semasa eksperimen transkripsi in vitro.
Apakah Persamaan Antara Benzonase dan DNase?
- Kedua-duanya adalah enzim hidrolitik.
- Kedua-duanya adalah nuklease.
- Kedua-duanya mengambil bahagian dengan memutuskan ikatan fosfodiester asid nukleik.
- Kedua-duanya memerlukan pH dan suhu penyimpanan yang optimum untuk mengekalkan aktiviti enzim.
- Inhibitor enzim termasuk agen chelating, logam peralihan, dan bahan kimia pencuci.
- Aplikasi terutamanya difokuskan pada mendapatkan ekstrak DNA, RNA, dan protein dengan kemurnian tinggi.
- Kedua-dua enzim dapat dihasilkan melalui kejuruteraan genetik.
Apakah Perbezaan Antara Benzonase dan DNase?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
Benzonase vs DNase |
|
| Benzonase adalah enzim yang mampu membelah DNA untai dua, DNA linear, DNA bulat, dan RNA. | DNase adalah enzim yang mampu membelah DNA helai dua. |
| Substrat untuk Enzim | |
| Kedua-dua DNA dan RNA adalah substrat untuk benzonase. | DNA adalah substrat untuk DNase. |
| Struktur | |
| Julat pH optimum Benzonase ialah 7.0 -8.0 | Julat pH optimum DNase I ialah 7.0 - 8.0 dan DNase II ialah 4.5 - 5.0. |
Ringkasan - Benzonase vs DNase
Enzim Nukase digunakan secara meluas dalam prosedur eksperimen yang berbeza berkenaan dengan biologi molekul dan kejuruteraan genetik. Benzonase dan DNase adalah dua jenis nuklease. Benzonase terlibat dalam merendahkan DNA dan RNA sedangkan DNase terlibat dalam pembelahan DNA helai dua. Ini adalah perbezaan asas antara benzonase dan DNase. Pada masa ini, kedua-dua jenis nucases ini dihasilkan melalui teknologi DNA rekombinan yang menghasilkan enzim berkualiti tinggi yang dioptimumkan untuk pengeluaran maksimum.
Muat turun Versi PDF Benzonase vs DNase
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam catatan petikan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara Benzonase dan DNase
