Perbezaan utama antara genocopy dan phenocopy adalah bahawa dalam genocopy, phenotypes menunjukkan kesamaan dan genotype berubah, sementara pada phenocopy, fenotip berbeza dan genotip tetap tidak berubah.
Perbezaan antara genocopy dan phenocopy terlibat dalam menjelaskan kejadian genetik yang jarang berlaku. Kedua-dua konsep menunjukkan bagaimana genetik tradisional atau genetik Mendel dapat berbeza-beza berdasarkan pengecualian dalam alam semula jadi. Genocopy merujuk kepada fenomena pemberian fenotip yang serupa walaupun mempunyai genotip yang berbeza. Sebaliknya, fenokopi merujuk kepada fenomena mempunyai fenotip yang berbeza-beza walaupun genotip tetap tidak berubah.