Perbezaan utama antara snRNA dan snRNP adalah bahawa snRNA adalah molekul RNA nuklear kecil sementara snRNP atau ribonukleoprotein nuklear kecil adalah molekul RNA nuklear kecil dengan protein.
snRNA bukan molekul RNA kecil yang aktif secara biologi dengan ukuran purata 150 nukleotida. Mereka biasanya terdapat dalam kaitan dengan protein sebagai snRNP dalam keadaan semula jadi. Oleh itu, snRNP adalah RNA nuklear kecil dengan beberapa protein khusus snRNP. snRNP terlibat dalam memediasi atau mengatur peristiwa pemrosesan RNA pasca-translasi seperti penyambungan, dll. Kedua-dua snRNA dan snRNP dijumpai di inti sel eukariotik.
