Perbezaan Utama - Pembaikan Eksisi Dasar vs Pembaikan Eksisi Nukleotida
DNA sering mengalami kerosakan kerana pelbagai faktor dalaman dan luaran. Walau bagaimanapun, sistem pembaikan selular segera dan berterusan memperbaiki kerosakan sebelum menjadi mutasi atau sebelum dipindahkan ke generasi yang akan datang. Terdapat tiga jenis sistem pembaikan eksisi dalam sel: pembaikan eksisi nukleotida (NER), pembaikan eksisi asas (BER), dan pembaikan ketidakcocokan DNA (MMR) untuk memperbaiki kerosakan DNA helai tunggal. Perbezaan utama antara pembaikan eksisi asas dan pembaikan eksisi nukleotida adalah bahawa pembaikan eksisi asas adalah sistem pembaikan sederhana yang berfungsi di dalam sel untuk memperbaiki kerosakan nukleotida tunggal yang disebabkan secara endogen manakala pembaikan eksisi nukleotida adalah sistem pembaikan kompleks yang berfungsi di dalam sel untuk diperbaiki secara komparatif kawasan yang lebih besar dan rosak disebabkan secara eksogen.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Pembaikan Eksisi Pangkalan
3. Apa itu Pembaikan Eksisi Nukleotida
4. Perbandingan Berdampingan - Pembaikan Eksisi Pangkalan vs Pembaikan Eksisi Nukleotida
5. Ringkasan
Apa itu Pembaikan Excision Base?
Pembaikan eksisi asas adalah versi sistem pembaikan DNA termudah yang dimiliki sel. Ia digunakan untuk memperbaiki kerosakan kecil pada DNA. Pangkalan DNA diubahsuai kerana deaminasi atau alkilasi. Apabila terdapat kerosakan asas, glikosilase DNA mengenali dan mengaktifkan sistem pembaikan eksisi asas dan memulihkannya dengan bantuan enzim AP endonuklease, DNA polimerase, dan DNA ligase. Langkah-langkah berikut terlibat dalam sistem BER.
- Pengiktirafan dan penghapusan pangkalan yang tidak betul atau rosak oleh glikosilase DNA untuk membuat laman web abasic (tapak kehilangan asas - laman web erapi atau apyrimidinik).
- Sayatan tapak abasik oleh endonuclease apurinik / apyrimidinic
- Penyingkiran sisa gula dengan lyase atau phosphodiesterase
- Pengisian jurang oleh polimerase DNA
- Penyegelan nama samaran dengan DNA ligase
Gambar 01: Laluan pembaikan excision asas
Apakah Pembaikan Eksisi Nukleotida?
Nucleotide Excision Repair (NER) adalah sistem pembaikan eksisi DNA yang penting dalam sel. Ia mampu memperbaiki dan mengganti kawasan yang rosak hingga 30 pangkalan dan diarahkan oleh helai templat yang tidak rosak. Kerosakan DNA yang biasa terjadi disebabkan oleh sinaran ultraviolet dan NER melindungi DNA dengan memperbaiki kerosakan tersebut sebelum menjadi mutasi dan berpindah ke generasi akan datang atau menyebabkan penyakit. NER secara khusus memberikan perlindungan terhadap mutasi yang disebabkan secara tidak langsung oleh faktor eksogen seperti karsinogen persekitaran dan kimia. NER dilihat di hampir semua organisma, dan ia menyedari kerosakan yang menyebabkan penyimpangan ketara pada heliks DNA.
Proses NER melibatkan tindakan banyak protein seperti XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, dan lain-lain dan diteruskan melalui beberapa mekanisme potong dan tampal. Protein tersebut sangat penting untuk menyelesaikan proses pembaikan, dan kekurangan pada salah satu protein NER sangat penting dan boleh menyebabkan sindrom resesif yang jarang berlaku: xeroderma pigmentosum (XP), sindrom Cockayne (CS) dan bentuk fotosensitif dari gangguan rambut rapuh trichothiodystrophy (TTD).
Gambar 02: Pembaikan Eksisi Nukleotida
Apakah perbezaan antara Repair Excision Base dan Nucleotide Excision Repair?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
Pembaikan Eksisi Pangkalan vs Pembaikan Eksisi Nukleotida |
|
| Base excision Repair (BER) adalah sistem pembaikan DNA yang berlaku pada sel. | Pembaikan eksisi nukleotida (NER) adalah jenis sistem pembaikan DNA yang terdapat dalam sel. |
| Mengenali Penambah DNA | |
| BER memperbaiki kerosakan pada tambahan DNA kecil. | NER membaiki tambahan DNA yang besar. |
| Kerosakan DNA | |
| BER menyedari kerosakan yang tidak menyebabkan penyimpangan ketara pada heliks DNA. | NER menyedari kerosakan yang menyebabkan penyimpangan ketara pada heliks DNA. |
| Punca Kerosakan DNA | |
| BER memperbaiki kerosakan yang disebabkan oleh mutagen endogen. | NER memperbaiki kerosakan yang disebabkan oleh mutagen eksogen. |
| Kerumitan | |
| BER adalah sistem pembaikan yang paling tidak rumit | Ia lebih kompleks daripada BER. |
| Keperluan untuk Protein | |
| BER tidak memerlukan protein lain. | NER memerlukan beberapa produk gen, terutamanya protein, untuk membezakan kawasan yang rosak dan tidak rosak. |
| Kesesuaian | |
| BER sesuai untuk memperbaiki kerosakan asas tunggal. | NER sesuai untuk menggantikan kawasan yang rosak. |
Ringkasan - Pembaikan Eksisi Dasar vs Pembaikan Eksisi Nukleotida
NER dan BER adalah dua jenis proses pembaikan eksisi DNA yang terdapat dalam sel. BER mampu memperbaiki kerosakan kecil yang disebabkan secara endogen sementara NER dapat memperbaiki kawasan kerosakan hingga 30 pasangan asas yang disebabkan kebanyakannya secara eksogen. BER berbeza dengan NER dalam jenis substrat yang diiktiraf dan dalam kejadian pembelahan awal. BER juga dapat mengenali kerosakan yang tidak disebabkan oleh penyimpangan ketara pada heliks DNA sementara NER menyedari penyimpangan ketara pada heliks DNA. Ini adalah perbezaan antara pembaikan eksisi asas dan eksisi nukleotida.
Image Courtesy:
1. "Dna repair base excersion en" Oleh LadyofHats - (Domain Awam) melalui Commons Wikimedia
2. "Perwakilan skema model untuk jalan pembaikan eksisi nukleotida yang dikendalikan oleh protein Uvr" Oleh Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui, dan Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) melalui Wikimedia Commons
