Perbezaan Utama - Exome vs Transkripome
Gen mengandungi kawasan pengekodan dan bukan pengekodan di dalamnya. Urutan pengekodan dikenali sebagai ekson, dan urutan bukan pengekodan dikenali sebagai inton. Urutan nukleotida ekson gen mewakili kod gen gen untuk mensintesis protein tertentu. Oleh itu, ekson kekal dalam molekul mRNA. Seluruh wilayah ekson genom dikenali sebagai exome, dan ia merupakan bahagian penting dari genom. Kod gen gen diubah menjadi kod genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk penghasilan protein. Seluruh molekul mRNA ditranskripsikan dalam sel atau populasi sel pada satu masa dikenali sebagai transkripome. Perbezaan utama antara exome dan transcriptome adalah bahawa exome mewakili urutan kawasan ekson genom sementara transkripome mewakili total mRNA sel atau tisu pada waktu tertentu.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Exome
3. Apa itu Transkripome
4. Perbandingan Berdampingan - Exome vs Transkripome
5. Ringkasan
Apa itu Exome?
Gen terdiri daripada urutan ekson, intron dan peraturan Exon adalah kawasan gen yang ditranskripsikan ke dalam urutan mRNA semasa transkripsi. Intron dan kawasan bukan kod lain dikeluarkan semasa transkripsi. Urutan nukleotida ekson menentukan kod gen gen yang mensintesis protein spesifik yang dikodkannya. Hanya ekson yang tinggal di dalam mRNA protein. Pengumpulan ekson dalam genom dikenali sebagai exome organisma. Ia mewakili bahagian genom yang dinyatakan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% dari genom. Ia adalah bahagian pengekodan protein dari genom manusia.
Gambar 01: Exome
Apa itu Transkripome?
Transkrip adalah pengumpulan semua transkrip protein-pengekodan dan bukan pengekodan (RNA) dalam tisu tertentu. Transkripome mewakili pengumpulan molekul mRNA yang dinyatakan oleh gen dalam sel atau tisu. Transkrip sel boleh diubah dengan transkripome jenis sel lain. Transkrip juga dinamik - ia berubah mengikut masa sebagai tindak balas terhadap rangsangan dalaman dan luaran. Walaupun dalam tisu yang sama atau dalam jenis sel yang sama, transkripome dapat berubah setelah beberapa minit.
Transkripome berbeza dengan exome organisma. Transkrip hanya merangkumi urutan eksome yang dinyatakan. Walaupun exome sel tetap sama, transkripome berbeza di antara sel kerana ekspresi gen tidak sama untuk semua sel atau tisu. Hanya gen penting yang dinyatakan dalam sel dan tisu yang berbeza. Ekspresi gen adalah proses spesifik jenis tisu atau sel. Ia diatur oleh pelbagai faktor termasuk faktor persekitaran. Oleh itu, transkripome boleh berbeza dengan keadaan persekitaran luaran.
Transkripome digunakan sebagai pendahulu untuk kajian proteomik. Semua protein berasal dari urutan mRNA. Pengubahsuaian terjemahan boleh mengakibatkan perubahan protein. Walau bagaimanapun, transkripome memberikan maklumat asas penting untuk kajian proteomik.
Gambar 02: Transkripome sel induk embrio
Apakah perbezaan antara Exome dan Transcriptome?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
Exome vs Transkripome |
|
| Exome adalah kumpulan kawasan pengekodan protein gen. | Transcriptome adalah koleksi semua RNA yang ditranskripsikan termasuk mRNA. |
| Contohnya | |
| Exome dikaji menggunakan sampel DNA. | Transkripome dikaji menggunakan sampel RNA. |
| Kaedah Kajian | |
| Penjujukan keseluruhan exome adalah kaedah mengkaji exome. | Penjujukan RNA adalah kaedah mengkaji transkripome. |
Ringkasan - Exome vs Transkripome
Exon adalah urutan pengekodan gen dan menentukan urutan mRNA protein. Pengumpulan urutan pengekodan (ekson) ini dikenali sebagai eksome organisma. Gen ditranskripsikan ke dalam molekul mRNA sebelum membuat protein. Jumlah molekul mRNA sel atau tisu pada masa tertentu dikenali sebagai transkripome. Transkripome mewakili gen yang secara aktif dinyatakan menjadi mRNA pada waktu tertentu. Transkripome adalah sel dan tisu khusus dan mempengaruhi keadaan persekitaran. Ini adalah perbezaan antara exome dan transcriptome.
