Perbezaan utama antara Cosmid dan Phagemid adalah pada jenis urutan yang terkandung di dalamnya. Cosmid mengandungi laman web cos dan plasmid. Oleh itu, ia adalah vektor hibrida sementara Phagemid adalah plasmid yang mengandungi asal F1 replikasi f1 F1.
Kosmid dan Phagemid digunakan untuk tujuan pengklonan, terutama untuk mengklon fragmen DNA yang lebih besar. Ini banyak digunakan terutamanya dalam pengklonan gen yang bertanggungjawab untuk pengeluaran pelbagai protein. Kosmid dan Phagemid sama ada direplikasi sendiri sebagai plasmid atau dibungkus ke dalam zarah virus dan kemudian direplikasi.