Perbezaan utama antara motif dan domain adalah bahawa motif tidak stabil secara stabil sedangkan domain stabil secara bebas.
Protein adalah makromolekul biologi penting yang terdapat di dalam badan kita. Sebaliknya, kod gen gen akan menentukan urutan asid amino protein. Lebih-lebih lagi, protein mempunyai struktur primer, sekunder dan tersier. Struktur utama adalah urutan asid amino rantai polipeptida. Apabila rantai polipeptida dilipat satu sama lain, ia membentuk struktur sekunder protein. Heliks alfa, helaian beta dan struktur super sekunder tergolong dalam struktur sekunder. Pengelompokan unsur super sekunder tertentu dikenali sebagai motif protein. Struktur tersier protein merujuk kepada struktur tiga dimensinya yang menentukan fungsi protein. Domain adalah bahagian lipatan molekul protein, yang berbentuk globular dan mempunyai fungsi diskrit. Ini adalah struktur asas fungsi dan tiga dimensi protein.
