Perbezaan utama antara ribosom prokariotik dan eukariotik adalah bahawa ribosom prokariotik adalah zarah 70S yang terdiri daripada subunit besar 50S dan subunit kecil 30S sementara ribosom eukariotik adalah zarah 80S yang terdiri daripada subunit besar 60S dan subunit kecil 40S.
Prokariota dan eukariota adalah dua kumpulan utama organisma hidup yang berbeza dengan organisasi selular. Prokariota tidak mempunyai organel sel inti dan membran. Sebaliknya, eukariota mempunyai inti sel dan organel sel yang terikat membran. Terdapat beberapa organel yang biasa bagi kedua-dua organisma. Ribosom adalah salah satu organel penting dan penting yang terdapat pada sel prokariotik dan eukariotik. Mereka terdapat di sitoplasma setiap sel. Secara struktural, protein dan RNA ribosom (rRNA) bersama-sama membentuk ribosom. Dan mereka terdiri daripada dua subunit iaitu subunit yang lebih besar dan subunit kecil. Juga, mereka menjalankan fungsi yang sama iaitu terjemahan molekul mRNA ke dalam protein. Oleh kerana terjemahan adalah proses penting untuk semua organisma hidup dan ia berlaku di ribosom,ribosom sangat penting untuk prokariota dan eukariota. Walaupun mempunyai banyak persamaan, terdapat beberapa perbezaan antara ribosom prokariotik dan eukariotik.