Perbezaan utama antara protein lengkap dan tidak lengkap adalah bahawa protein lengkap mengandungi jumlah yang mencukupi dari semua sembilan asid amino penting sementara protein tidak lengkap kekurangan satu atau lebih daripada sembilan asid amino penting.
Protein adalah makromolekul yang melakukan banyak fungsi penting dalam badan kita. Oleh kerana ia sangat beragam, protein ini menjalankan banyak fungsi yang berbeza dalam tubuh kita, termasuk pemangkinan enzim, fungsi pertahanan, pengangkutan, sokongan, gerakan, dan peraturan. Dua puluh asid amino yang berbeza bertindak sebagai penyusun untuk membuat molekul protein yang besar. Secara amnya, urutan asid amino dan sifat kimia rantai sampingannya (kumpulan R) menentukan struktur utama, ukuran, bentuk, dan panjang setiap molekul protein; oleh itu, setiap protein adalah unik di dalam badan kita.
Asid amino yang terdapat dalam protein boleh dikategorikan kepada dua: asid amino penting dan tidak penting. Asid amino tidak penting boleh dihasilkan di dalam badan itu sendiri sementara asid amino penting mesti diperoleh melalui makanan kerana ia tidak dapat dihasilkan oleh badan itu sendiri. Sangat penting untuk mengambil makanan yang kaya dengan protein untuk mendapatkan semua asid amino penting yang diperlukan untuk mengekalkan fungsi tubuh yang paling penting. Istilah 'lengkap' dan 'tidak lengkap' terutamanya mengkategorikan sumber protein berdasarkan jenis asid amino yang terdapat di dalamnya.