Perbezaan utama antara pengoksidaan dan penapaian bergantung pada jenis tindak balas kimia. Oksidasi adalah proses kimia di mana suatu senyawa mengalami pengoksidaan di hadapan oksigen sementara fermentasi adalah proses kimia menghasilkan asid, alkohol dan karbon dioksida dari gula tanpa adanya oksigen.
Pengoksidaan dan penapaian adalah proses biokimia. Mereka berlaku secara semula jadi pada organisma hidup di bawah pengaruh enzim dan kofaktor lain. Pada masa kini, kedua-dua reaksi semula jadi ini mengambil bahagian dalam pengeluaran molekul biologi berskala industri. Oleh itu, memahami proses ini dan membezakan keduanya sangat penting. Oleh itu, artikel ini memberi tumpuan untuk membincangkan perbezaan antara pengoksidaan dan penapaian.