Perbezaan utama antara atom dan zarah adalah bahawa atom adalah unit kecil yang terbuat dari beberapa zarah, sedangkan zarah adalah bahagian jirim.
Atom adalah unit terkecil dari semua jirim. Pada masa lalu, orang berpendapat bahawa atom adalah benda terkecil yang ada dan kita tidak dapat memecahnya lebih jauh. Tetapi menurut kajian penyelidikan baru-baru ini, atom itu terbuat dari beberapa zarah kecil yang disebut zarah subatom. Walau bagaimanapun, istilah zarah dalam kimia merujuk kepada sebarang objek kecil yang mempunyai sifat fizikal seperti isipadu, ketumpatan dan jisim.