Perbezaan utama antara saluran ion berpagar voltan dan ligan adalah bahawa saluran ion berpagar voltan terbuka sebagai tindak balas kepada perbezaan voltan sementara saluran berpagar ligan terbuka sebagai tindak balas terhadap pengikatan ligan.
Pengangkutan membran adalah mekanisme penting yang membolehkan ion masuk dan melepaskan sel. Oleh itu, saluran ion adalah molekul penting yang membantu dalam pengangkutan membran. Walaupun begitu, kebanyakan saluran ion tertanam dalam membran sel, dan ia adalah protein. Walau bagaimanapun, sebilangannya boleh menjadi protein saluran sementara yang lain adalah pembawa. Protein saluran terdiri daripada dua jenis; saluran berpagar atau saluran tidak berpagar. Saluran ion berpagar adalah tiga jenis; iaitu voltan berpagar, ligan berpagar dan saluran ion teraktif tekanan Bahagian kemasukan kedua-dua saluran ini biasanya ada seperti tertutup, dan hanya dibuka dalam keadaan tertentu sahaja.
