Perbezaan utama antara protomer dan capsomeres adalah bahawa protomer adalah unit struktur protein oligomerik sedangkan capsomeres adalah protein individu yang terdiri daripada protomer, yang merupakan subunit struktur dari kapsid virus.
Virus adalah parasit obligat intraselular, yang merupakan zarah berjangkit. Kapsid adalah salah satu daripada dua komponen utama zarah virus. Ini adalah lapisan protein yang mengelilingi dan melindungi genom virus. Kapsid terdiri daripada protomer, yang merupakan unit struktur protein oligomer. Capsomere adalah subunit struktural dari kapsid virus, dan ia adalah gabungan beberapa protomer sebagai satu unit. Oleh itu, protomer berkumpul sendiri untuk membentuk sebuah capsomere dan capsomeres sendiri untuk membentuk sebuah capsid.
