Perbezaan utama antara reseptor AMPA dan NMDA adalah bahawa agonis reseptor AMPA spesifik adalah alpha-amino - 3 - hydroxyl - 5 - methyl - 4 - isoxazole propionic acid (AMPA), sementara agonis spesifik reseptor NMDA adalah N - metil - D - aspartat (NMDA).
Terdapat tiga jenis reseptor glutamat utama. Perbezaan mereka berdasarkan pada agonis yang mengikat untuk pengaktifan reseptor untuk pengikatan glutamat. Pengikatan glutamat akan membuka saluran berpagar ion untuk pengangkutan ion natrium dan kalium. Juga, reseptor NMDA juga memudahkan aliran ion kalsium merentasi membran.
