Perbezaan utama antara anammox dan denitrifikasi adalah bahawa anammox merujuk kepada pengoksidaan amonium anaerob, yang mengubah amonium dan nitrit menjadi gas nitrogen dalam keadaan anoksik. Sementara itu, sementara denitrifikasi adalah transformasi biologi nitrat menjadi N 2 dengan bakteria denitrifikasi.
Kitaran nitrogen adalah kitaran biogeokimia yang penting di mana nitrogen diubah menjadi bentuk kimia yang berbeza seperti NH 3, NH 4 +, NO 2 -, NO 3 -dll. Terdapat empat proses utama yang dilihat dalam kitar nitrogen. Mereka adalah fiksasi, amonifikasi, nitrifikasi, dan denitrifikasi. Sebilangan besar proses ini dilakukan oleh mikroorganisma, terutama bakteria yang terdapat di dalam tanah. Anammox adalah salah satu penambahan terbaru pada kitaran nitrogen. Ia adalah proses pengoksidaan amonium anaerob. Kumpulan bakteria tertentu yang dikenali sebagai planctomycetes menjalankan proses ini. Mereka memiliki organel khas yang disebut anammoxosomes, yang menyediakan tempat untuk reaksi anammox. Walau bagaimanapun, pada akhirnya, kedua-dua denitrifikasi dan anammox menghasilkan gas nitrogen.
