Perbezaan utama antara archenteron dan blastocoel adalah bahawa archenteron adalah usus utama yang terbentuk semasa gastrulasi pada zigot yang sedang berkembang, yang kemudiannya berkembang menjadi tiub pencernaan, sementara blastocoel adalah rongga dalam yang berisi cecair atau kuning telur dari blastula yang terbentuk semasa ledakan.
Persenyawaan adalah kejadian pembiakan seksual yang membentuk zigot diploid. Zigot akhirnya berubah menjadi embrio. Embrio mengalami pembelahan mitotik dan pembezaan sel, menjadikan embrio multiselular. Morula adalah peringkat awal embrio, yang mengandungi 16 sel. Morula menjadi blastula di celah ketujuh. Blastula mengandungi 128 sel. Ia adalah sfera sel berongga yang mengelilingi rongga berisi cecair dalaman. Dan, rongga blastula yang berisi cecair ini dikenali sebagai blastocoel. Blastula melipat ke dalam dan membesar untuk membuat gastrula, yang merupakan struktur berlapis yang mengandungi lapisan kuman primer. Archenteron adalah usus utama yang terletak di gastrula. Archenteron berkembang menjadi saluran pencernaan kemudian.
