Perbezaan utama antara RP HPLC dan HIC ialah RP HPLC menggunakan fasa bergerak yang lebih polar dan fasa pegun yang kurang polar. Manakala, HIC menggunakan fasa pegun hidrofobik yang membolehkan molekul hidrofobik melekat padanya.
Kromatografi adalah teknik analisis yang membantu memisahkan campuran ke dalam komponennya. Pertama, kita mesti membubarkan sampel untuk dipisahkan menjadi larutan. Campuran larutan-bahan ini disebut fasa bergerak. Kemudian fasa bergerak dilalui bahan lain yang disebut fasa pegun. Fasa pegun menentukan pemisahan komponen. Pemisahan berlaku kerana pemisahan bahan antara fasa bergerak dan fasa pegun.
