Perbezaan utama antara fasa terbalik dan fasa normal HPLC adalah bahawa HPLC fasa terbalik menggunakan fasa tak bergerak nonpolar dan fasa bergerak polar sedangkan HPLC fasa normal menggunakan fasa pegun polar dan fasa bergerak kurang kutub.
HPLC fasa normal adalah teknik HPLC tertua yang digunakan Tswett dalam pemisahan ekstrak tumbuhannya; dia menggunakan kapur di lajur kaca. Ini adalah kaedah kromatografi klasik yang menamakannya sebagai teknik "normal". HPLC fasa terbalik, sebaliknya, adalah kebalikan dari teknik biasa, yang dikembangkan oleh saintis akhir-akhir ini.
