Perbezaan utama antara kekhususan substrat dan kekhususan ikatan adalah bahawa kekhususan substrat adalah kemampuan enzim untuk memilih substrat yang tepat yang dapat diikatnya dari sekumpulan sebatian yang serupa sedangkan kekhususan ikatan adalah kemampuan enzim untuk memilih substrat yang mempunyai ikatan dan struktur serupa.
Istilah kekhususan substrat dan kekhususan ikatan berada di bawah bidang biokimia, mengenai aktiviti enzim. Kita boleh menentukan enzim sebagai pemangkin biologi. Ini bermaksud, enzim adalah sebatian yang dapat meningkatkan kadar fungsi biologi yang berlaku dalam sel, tetapi tidak dimakan selama fungsi tersebut. Istilah kekhususan merujuk kepada cara ikatan enzim tertentu dengan substrat tertentu.
