Transposon vs Retrotransposon
Transposon dan retrotransposon adalah komponen genetik DNA, dan terdapat perbezaan besar di antara keduanya. Peratusan kehadiran bahan genetik ini berbeza-beza di setiap spesies, dan fungsinya menentukan nasib organisma dengan mutasi dan perubahan penting secara fenotipik. Transposon dan retrotransposon adalah gen atau kumpulan gen tertentu yang terletak di helai DNA, dan perubahan lokasi mereka menjadi penyebab utama akibat ini. Walau bagaimanapun, artikel ini bermaksud untuk membincangkan fungsi gen ini secara ringkas dan memberikan perbandingan antara transposon dan retrotransposon.
Apa itu Transposon?
Transposon adalah serpihan atau segmen DNA yang menarik dengan kemampuan mengubah lokasi helai DNA dalam bentuk mekanisme potong dan tampal. Kerana sifat transposon mudah alih ini, ini dikenali sebagai gen melompat. Transposon terdiri daripada dua jenis utama yang dikenali sebagai Transposon Kelas I dan Transposon Kelas II. Biasanya, jenis Kelas II disebut sebagai transposon dan jenis Kelas I disebut sebagai retrotransposon. Proses memotong dan menampal segmen DNA mudah alih diatur oleh transposase enzim. Enzim mengikat ke kedua ujung transposon dan memotong ikatan fosfodiester untai DNA, mengasingkan transposon, memindahkannya ke lokasi sasaran, dan mengikat di lokasi baru. Namun, proses ini menarik untuk difahami,kerana beberapa transposon hanya dapat berpindah ke lokasi tertentu hanya kerana ketidaksesuaian urutan asas dengan laman web sasaran. Gen dengan satu hujung helai tunggal mempunyai urutan asas yang sama dengan ujung helai tunggal yang lain adalah transposon dengan tepi melekit, kerana gen tersebut dapat mengikat ke tapak helai DNA sasaran dengan urutan asas yang sama seperti pada hujung melekit. Walau bagaimanapun, mobiliti gen ini boleh menyebabkan perubahan genotip dan juga pada fenotip organisma. Para saintis mencipta mengenai transposon dan makanan dan organisma yang diubahsuai secara genetik mengikut penyesuaian yang disukai kemudian disediakan. Tanaman pertanian yang sangat produktif, antibiotik dengan sifat perubatan,haiwan ternakan adalah beberapa produk yang dikembangkan dengan baik setelah penemuan transposon oleh Barbara McClintock pada tahun 1940-an.
Apa itu Retrotransposon?
Retrotransposon adalah transposon Kelas I, dan ini bergerak melalui genom melalui mekanisme salin dan tampal. Mekanisme mobiliti retrotransposon melibatkan beberapa langkah utama seperti menyalin segmen gen untai DNA ke RNA, memindahkan salinan RNA ke lokasi sasaran, transkripsi urutan RNA kembali ke DNA menggunakan transkripase terbalik, dan memasukkan gen ke lokasi baru untai DNA genom. Kedua-dua hujung retrotransposon ini biasanya mempunyai ulangan terminal yang panjang dengan kira-kira 1000 pasangan asas, dan kedua-duanya digunakan sebagai ciri pengenalan gen ini. Gen ini mudah dikuatkan di dalam genom, dan peratusan retrotransposon pada genom manusia adalah sekitar 50%. Ini boleh menjadi sangat berbahaya kerana virus penyebab AIDS, HIV,dan virus leukemia sel T mempunyai retrotransposon dalam genom RNA mereka. Sebenarnya, virus ini dapat mengikat retrotransposon ke mana-mana tapak helai DNA manusia dengan penggunaan transkripase terbalik dan integrase. Enzim integrase berfungsi dengan cara yang sama seperti transposase dalam transposon Kelas II.
Apakah perbezaan antara Transposon dan Retrotransposon?
• Transposon adalah gen lompat Kelas II sementara retrotransposon tergolong dalam kategori Kelas I.
• Transposon berfungsi dengan enzim transposase sedangkan retrotransposon berfungsi dengan penggunaan dua enzim utama yang dikenali sebagai transcriptase terbalik dan integrase.
• Hujung terminal lebih panjang di retrotransposon daripada di transposon.
• Transposon dipotong dari asal dan ditampal pada sasaran; sebaliknya, retrotransposon disalin dari asal ke RNA dan ditranskrip pada sasaran.
• Pergerakan retrotransposon melibatkan RNA tetapi tidak pada transposon.
