Perbezaan utama antara Pepsin dan Protease adalah bahawa pepsin adalah salah satu jenis protease sementara protease adalah enzim yang membelah protein menjadi asid amino.
Protein adalah makromolekul penting yang dibuat daripada asid amino yang berbeza. Asid amino adalah blok asas protein, dan mereka berpolimerisasi menjadi protein dengan ikatan amida. Beberapa enzim dapat memecah protein menjadi asid amino, dan mereka dikenali sebagai protease. Terdapat pelbagai jenis protease yang berbeza mengikut mekanisme hidrolisis. Antaranya, pepsin, yang merupakan protease gastrik adalah salah satu jenisnya.
