Perbezaan utama antara ion polyatom dan sebatian adalah bahawa ion polyatom mempunyai muatan elektrik positif atau negatif sedangkan sebatian tersebut tidak mempunyai muatan elektrik bersih.
Ion polyatom adalah istilah yang kita gunakan untuk menamakan spesies kimia yang mengandungi dua atau lebih atom yang mempunyai muatan elektrik negatif atau positif. Muatan elektrik ion ini adalah hasil bilangan elektron yang ada di setiap atom; jika terdapat lebih banyak elektron daripada jumlah proton dalam atom, ia akan mendapat cas negatif bersih dan sebaliknya. Sebaliknya, sebatian adalah spesies kimia tanpa cas elektrik. Mereka mempunyai bilangan elektron dan proton yang sama.