Perbezaan utama antara virus dan prion adalah bahawa virus adalah zarah berjangkit kecil yang terdiri daripada asid nukleik dan lapisan protein sementara prion adalah zarah berjangkit kecil yang terdiri daripada satu protein.
Terdapat pelbagai jenis entiti biologi yang dikaji oleh ahli mikrobiologi. Antaranya, virus dan prion adalah dua jenis zarah berjangkit acellular. Mereka tidak dianggap sebagai organisma hidup kerana menunjukkan lebih banyak ciri bukan hidup daripada ciri hidup. Begitu juga, mereka tidak mengandungi ribosom dan enzim untuk mensintesis protein. Oleh itu, mereka memerlukan organisma hidup (inang) untuk membiak. Selanjutnya, mereka tidak dapat diperhatikan di bawah mikroskop cahaya, dan mereka tidak dapat disaring oleh penapis Chamberland. Lebih-lebih lagi, mereka tidak dapat dikultur dalam media nutrien. Perbezaan antara virus dan prion terutama disebabkan oleh komposisinya. Virus terdiri daripada asid nukleik dan protein sementara prion hanya terdiri daripada protein. Begitu juga, terdapat beberapa perbezaan antara virus dan prion yang akan dibincangkan oleh artikel ini.
